La Secretaría General es una dependencia del Rectorado de la UNSE, cuya misión está orientada a:
• Asistir al Rectorado en la tramitación, estudio, resolución y ejecución de los asuntos relativos al despacho general y los aspectos técnicos-legales.
• Velar por el cumplimiento de la Ley de Procedimiento Administrativo, sus modificaciones y Decretos Reglamentarios, buscando que los mismos se caractericen por su simplicidad, rapidez, sencillez y precisión de términos.
• Actuar como contralor de todo procedimiento administrativo y de los expedientes, desde que se inician hasta que concluyen.